Madagaskar'ın ilk sakinleri Endonezya'dan gelen göçmenlerdi.

Madagaskar adası, Afrika'nın doğu sahilinden 400 kilometre uzaklıktadır. Adanın modern nüfusu - Madagaskar - muhtemelen Borneo adasından veya Kalimantan'dan göçmen olan Doğu Asya halklarıyla Afrika Bantu halklarının karmaşık bir karışımıdır. Ancak, ilginç bir şekilde, yerel halk, Austronesian dil ailesine ait dili konuşur. Evet, teraslı pirinç ekiminden başlayıp konut mimarisinin Asya özellikleri ile sona eren birçok yerel gelenek, adanın birincil Endonezya yerleşimini göstermektedir. Ancak, başlangıçta adanın Afrika kıtasından gelen göçmenlerin aşiretlerinin yaşadığı varsayılması daha mantıklı olacaktır. Ve sonra, Borneolu göçmenler onlara katıldı; çünkü Endonezya adaları Madagaskar'dan 5.000 kilometreden daha uzakta.

Bilim adamları uzun süredir ada nüfusunun oluşumu konusunda hemfikir olamadılar. Ancak tarihçilere ve etnograflara yardım eden genetikçiler sonunda Madagaskar'ın yerleşiminin sırrını ortaya çıkarmayı başardılar. Bir grup uluslararası bilim insanı, adanın farklı yerlerinde bulunan 250 köyde yaşayan 2.700'den fazla insanın DNA'sını inceledi. Genetik verilerin analizinde, modern Madagaskaryanın aynı anda Afrika Bantu halklarının ve Endonezyalıların soyundan geldiği doğrulandı. Dahası, adanın farklı bölgelerinde, belirli genlerin baskınlığı değişkenlik gösterir. Kuzey kesimde Afrika genleri baskındır ve güney ve orta kesimde çok sayıda Endonezya genine sahip halklar baskındır.

Ayrıca, genetik analiz yardımı ile çeşitli göçmen popülasyonlarının yaşının belirlenmesinin mümkün olması da ilginçtir. Madagaskar ve Afrika atalarının ayrılışı yaklaşık 1500 yıl önce meydana geldi. Fakat genetikçilere göre, adalıların Endonezyalılardan Borneo'dan ayrılması, yaklaşık 2000-3000 yıl önce gerçekleşti. Göçmenlerin kompozisyonundaki farklılıkları tanımlamak da mümkündü. Endonezya göçü, yaklaşık olarak eşit oranlarda kadın ve erkek akını içeriyordu. Afrikalı göçmenler ağırlıklı olarak erkekken. Orta Doğu nüfusu ile küçük bir ilişki de keşfedildi. Anlaşıldığı üzere, Madagaskar halklarının oluşumuna da katkıda bulundular.